(一)会计报表不够合理
会计报表是医院成本核算的重要依据，但是现在的会计报表中仍然存在模棱两可的状况，严重困扰医院成本核算，不能为医院的成本控制提供精确的数据信息，同时也没有体现医院在研究、服务等专项的实际工作状态，这样就难以反映医院成本的规律运作和经济结构体系的准确性。
(二)会计信息遗失问题没有解决
财务工作者的财务信息质量是会计工作的命脉，直接关系到领导下达的各项指令和决策。由于在旧制度中就一直存在一个错误现象，就是会计信息失真，这个问题至今没有解决，于是就造成了会计工作面临数据不真实而带有虚编滥造的嫌疑，完全不符合财务工作的细致精准要求，也就无法完成医院成本控制的任务，严重阻碍成本控制工作的开展。建议尽快制定相关核算制度，对旧账务进行处理和归类，重新整理相关数据，保证实际项目的精准性。
(三)管理费用支出不明确
由于会计核算制度的核算科目不够完善，导致医院的管理费用由人员在医疗成本和药品成本之间抽取进行平均分配，严重扰乱了医疗成本高度准确的制度，损害相关体制的运作，也不会为我国的社会保障体系做准确的基础信息。因此，管理费用的相关政策必须强制规定管理费用的出处，并且不断完善管理费用体制，加强医院成本管理体制建设。
(四)对拖欠账务信息管理不合理
医院的新型会计核算制度中，没有明确规定医院的坏账怎么提取，也没有严格要求坏账损失不得在实际在院人员费用中提取，这样会打乱坏账的有效数据，不能准确及时的反应当前坏账。关于拖欠账务的信息，必须单独核算，建立统一的电子系统，只允许从离院人员未缴清费用选择在两年以上(包括两年)的账目，对于收回可能性很小的账目做个统计，不要涉及在院人员拖欠费用，这样就可以明确了解拖欠医院的欠费坏费情况。
(五)财务报表不够系统
目前，很多财务表格难以满足大多数人的需求，随着社会经济体制改革，人们已经不能满足于医院的目前的静态财务信息，更关注医院动态财务运作，因此建立相关的动态财务报表，不断完善财务报表的丰富性也是医院的新型会计核算制度中最为关键的一点。文章指出在各项管理制度报表中建立附页或者附注制度。
(六)管理工作有待加强
医院成本管理是医院工作的重要组成环节，管理工作在医院财务工作中占有主导地位，医院的新型会计核算制度中缺少对会计核算管理制度的阐述。成本管理不明确易造成人为扭曲医院服务的宗旨，人为利用医疗支出为个人谋福利，严重影响社会和医院的和谐发展。因此，必须加强医院成本管理建设工作，明确管理条例和惩罚措施，严格遵守医院成本管理条例，履行医院会计工作者的义务，为社会主义改革建设做好工作。综上所述，医院的新型会计核算制度的颁布既推动了医院财务工作的发展，同时又存在着不可忽视的问题，新制度要求医院财务部门严于律己，以身作则，在适应医院的新型会计核算制度的同时不断创新，逐步完善医院核算制度。为做好社会主义经济体制改革而奋斗，必会迎来医院会计核算工作的全新局面。
总结：新医院会计核算制度利弊释解到这里就全部结束了。
