一是地方政府的执行动力不足。
土地增值税的严格征收，对于增加地方财政收入，优化地方财政收入结构具有积极作用。但对开发商大量征收土地增值税，势必会降低地方在房地产开发上的投资引入,进而影响地方的经济增长。根据现有税收体制，土地增值税清算所得只有50%留给地方，使得地方政府不愿“舍大求小”，在清算政策执行上显得动力不足，难以形成好的执法环境。
二是土地增值税计算方式较为复杂。
清算工作涉及复杂的扣除项目，包括取得土地使用权所支付的金额、房地产开发成本、房地产开发费用、与转让房地产有关的税金等等。再加上房地产项目的开发周期一般较长，投资活动比较复杂，如果是滚动开发的房地产企业，对其进行查账核算往往需要投入大量的人力、物力，基层税务部门要按通知要求做到“每项目必清算”确有难度。
三是项目运作制增加了清算的难度。
一些房产项目原属合作开发，房产公司也系临时组建，企业账目较为乱，不少项目建成后公司立即注销，投资者分钱走人，现在回头要求其清算补交税款，不仅征管成本较高，而且因为历时较久，个别投资商的经济状況发生变化，要完全追缴到位也显得困难重重。
四是中介机构出具的鉴证报告不规范。
由于中介机构没有经过土地增值税业务相关培训，虽然新《清算管理办法》严格规定了鉴证报告格式，但一次符合要求的却极少，审核鉴证报告需要很大一部分精力。目前，基层税务所日常征管、纳税评估等工作压力已经很大，在土地增值税清算管理方面确实难以兼顾，这也是清算工作进展不快的一个重要原因。
针对以上问题，提出以下做好土地增值税清算管理工作的建议：
一是建立激励机制，提高地方积极性。针对土地增值税清算政策对地方经济工作产生的实际影响和当前地方政府执行积极性不高的现实问题，提高土地增值税地方留成比例，以此调动地方政府的积极性，为基层税务部门迅速打开局面、促进土地增值税征缴工作步入常态提供支持。
二是加强宣传引导。通过开展宣传，使社会各界进一步认识到，土地增值税清算管理工作是国家近两年出台一系列金融、税费调控政策之后，围绕房地产行业的调控管理采取的又一重要举措，其落实与否直接影响广大群众的切身利益，关系国家经济的稳健运行；把能否做好这项工作作为检验税务干部依法治税能力和评价地方党政机关依法行政水平的标准，为政策的有效落实提供良好的思想基础和舆论环境。
三是加强业务培训。采取集中办班或抽调学习的形式，尽快为基层税务机关培养一批熟悉建筑安装工程业务和房地产项目开发流程的工作骨干，提高基层税务干部在土地增值税清算管理工作中的执行能力。
四是加强资源整合。制定相应的激励和管理办法，规范中介机构鉴证行为，有效整合社会资源，减轻基层税务部门的工作强度，进一步提高清算管理工作的效率和质量。
土地增值税清算管理存在问题及建议责任编辑：飞雪 阅读：人次
