每年答辩季节都要评审学位论文，每年自己学生的论文也都反复修改。但无论怎么细心，错误总还是有。遗憾依旧在，只是换新人。那么什么样的学位论文才是好论文呢？实际上大家也很明白，心里也都清楚。网上每年公布的国家优秀博士学位论文，科学院的优秀博士学位论文等，都是些典范（尽管也有些被指出有一些缺点，总体看应该是没有大问题的）。有些海归回来的教授们的论文自然也是优秀的。样板处处有。
作为交流吧，我还是想从一个导师的角度，针对我接触到的国内的学位论文情况，谈点粗浅的看法，希望对我自己的学生和其他感兴趣的研究生有些益处。就以流水帐形式写吧。题目：学位论文题目要简明、确切，不罗唆，不冗长。评委或读者一看题目就知道你的主要工作。有些同学是在博士期间做了几个不同的内容，这样题目就很难表达准确题意。可以突出一点，但不要将不是很密切的几个内容都写在一个题目上。还有些论文是几个不相干的内容，这样题目就更难定了（这种设计本来就先天不足）。不管怎样，一个题目就是一个主题，只能有所舍取。如果都罗列上，实在是不伦不类。还有些论文是一个大主题下的一点点工作，如果需要，可以以副标题的形式给出更多的信息。特别提醒：注意论文题目可千万不要有错别字，尤其是在封面上。摘要：简明扼要是主要的。摘要是一篇论文的浓缩和精华。内行的人看摘要就知道你的主要发现和结论，外行的人也能了解你做了什么，得到了那些重要发现。因此，选题的意义（理论和应用），用什么方法（尤其是先进设备和技术）做了哪些工作？获得了哪些主要结果和结论？是摘要的主要内容，但不需要罗列很多。一篇学位论文不可能有很多重大发现，但是一篇学位论文没有一点闪光的地方也是不可能的。因此要下功夫挖掘自己结果的重要性和结论的重要性。特别提醒：一篇论文切忌没有结论。英文摘要：最基本的要求是要可读，没有语法错误(readable and correct English)，如果语言地道那就最好了。一旦语法、拼写、时态、单复数、语态等等，出现多个不足，一般读者就没有欲望再读下去了。前言：有些学位论文有一个大前言。所谓大前言，就是相对每个章节而言，每个章节内往往还有一个前言。前言要讲清楚研究背景，论文涉及到的研究内容的相关进展，主要是学说、理论等方面的发展，国内外现在存在的争论，遗留的问题等等。然后要介绍所研究的对象，相关的研究积累，已经有的主要发现，还没有解决的问题或者值得进一步解决的问题。根据积累和国内外学科领域的发展，围绕感兴趣的科学问题，提出科学假说（Hypothesis），根据科学假说，提出预测 (Prediction)等。这也就是研究的目的了。选准了问题，目的就明确了。
许多论文是没有问题，没有假说，只是说国内还没有相关资料，因此我就做了。现在的科学（尤其是生物科学），多数是以假说驱动的研究(hypothesis-driven)，达尔文时代的那种博物学(Natural history)式的研究还是很重要，但是已经不是主流了。因此，如果你从事的不是野外考察研究，不是需要经过大量的考察和积累后才能获得一些结论性的内容的研究的话，一定要注意当今这种“问题－假说－预测－设计－实验－数据分析”的流程思维的培养。在前言中，要注意告诉读者这项研究在科学上的重要意义在哪里，相关结果在科学发展上会有哪些贡献。如果对国计民生有重大贡献是一定要说明的。特别提醒：切忌前言写成堆积文献而没有介绍研究背景。研究意义和目的一定要明确突出。所引用的图表一定要注明出处。材料和方法；这部分是相对容易写的。用什么设备，什么技术，什么配方，测定哪些指标等等。但是论文写作还是要有逻辑的，首先不要写成大学的实验报告，有些学生将使用的化学试剂列一个表，注明公司和产品信息等。这没有必要，也不能这样写。应该是将相关信息融在文字里面，如测定什么指标，用什么试剂，在什么设备上测定，这样就将参数、试剂、仪器、方法等连起来了。再者，生物学实验是有内在逻辑性的（其他学科不清楚），如生理学实验中，如果动物还没有处死，就不能先描述血液激素等的测定方法、组织线粒体的测定方法等，还是要按照常规逻辑进行，如实验动物来自哪里？如何饲养？饲养条件（温度、光照、食物成分、笼具规格… …），怎么进行实验处理？处理时间？收集哪些参数和指标？什么时间收集？什么时间处死动物？器官组织如何处理？… …这些信息都需要详细给出，不能简略，还有注意内在逻辑性。
值得提醒的是，如果不是自己创立的方法，所采用的方法和技术的描述一定要列出相关的参考文献。生物学研究中当今特别关注数据统计。统计方法的描述要特别注意，不同的参数类型要使用不同的分析方法，要说明具体的分析方法。如行为学数据不是正态分布的数据，有些数据是同一批动物在不同时间取样（重复性测定数据），有些是季节采样（有不同动物，也有相同动物通过标记进行季节采样），有些数据是百分比… …具体的数据采用什么统计学方法是需要注意和描述清楚的。材料方法部分与前言部分是密切相关的，前言中计划要验证的相关假说，需要什么样的实验处理，测定哪些指标才能实现，这些信息就需要在材料和方法部分详细介绍。特别提醒：材料和方法切忌简化、他人不能重复。每个方法如果不是独创，都要有来源。
