卫生监督协管档案管理是指对卫生监督协管本底资料、监督检查情况、群众投诉举报记录、工作记录和相关文件等信息进行收集、整理、保管。
一、卫生监督协管档案资料应按上级文件、计划总结、会议记录、投诉举报、转交案件、宣传培训、年度报表、被监督单位本底资料、行政相对人监督档案等项目进行分类，并装订成册。
二、档案分类及内容：
1、上级文件：上级卫生行政部门和卫生监督机构下发的文件。
2、计划总结：卫生监督协管室年度工作计划、总结、情况汇报、检查安排、其他专项工作小结及图片资料等。
3、会议记录：卫生监督协管室召开或参加各类工作会议应留有记录。
4、投诉举报：群众投诉举报的受理和查处结果记录。
5、转交案件：卫生监督协管员向县卫生监督所转交案件的交接文字性材料以及处理结果。
6、宣传培训：卫生监督协管开展卫生法律法规宣传活动的计划、总结、宣传资料、工作记录及图片影像资料；卫生监督协管参加县卫生监督所组织的培训活动课件、学习笔记；卫生监督协管对卫生监督信息员开展培训活动的培训计划、通知、课件、签到册、试卷及图片资料。
7、年度报表：每年报送卫生监督协管工作信息汇总表的存档。
8、被监督单位本底资料：卫生监督协管辖区单位名册。
9、行政相对人监督档案：按照职业卫生、公共场所卫生、餐饮单位、供水单位和医疗机构进行划分，并做到一户一档。每户行政相对人监督档案中应包含：被监管单位的名称、地址、负责人、卫生知识培训、从业人员健康证持有情况和卫生监督协管现场检查记录、卫生监督意见书及存在的主要问题等。
