一、目前公立医院经济运行管理存在的问题
(1)公立医院粗放式管理模式跟不上改革发展的步伐。
目前，我国大多数医院管理还停留在粗放式管理层面，医院管理者长期以来缺乏系统性、规范性的医院管理培训，许多医院在管理上过分注重医疗技术的提高、固定资产规模的扩张，忽略医院内部系统化、精细化管理，忽视内涵建设和职业化管理队伍的培训。如果这种状况不改善，很难适应医疗改革的步伐，也会造成医疗卫生资源的浪费，影响医院的可持续发展，降低医疗服务体系的整体效率。
(2)预算编制流于形式，预算执行缺乏权威性。
预算管理是医院管理最重要的工作之一。但现在大部分医院对预算管理的重要性认识不足，往往认为财务部门自己去完成预算编制和执行等全部的工作，造成编制的预算流于形式，可执行性不高;实际还行中很多单位不按预算执行，资金支出不受预算控制;很多医院的考核体系没有参考预算，预算是预算，考核是考核，预算没有与绩效工资挂钩。等等造成预算管理缺乏权威性，未能起到应有的效果。
(3)全成本核算工作实施不力，成效不大。
全成本核算在执行新医院会计制度以后虽然在公立医院中得到了全方位的实施，但是实施效果不佳。核算成本数据的准确性有些低，急需规范成本核算分配的原则，所以，成本核算的结果利用率不高，成本核算管控的作用不能得到有效发挥。
(4)公立医院缺少全面的财务分析与评价体系。
目前，多数医院对财务分析不够全面，财务报告仅对医院收支结余、资产及负债等基础内容进行分析，很少对医院的预算执行情况、资产运营能力、成本管理能力、发展能力及工作效率等方面进行分析，因此无法为医院管理者提供全面、准确、完整的财务数据，容易造成医院管理者的决策失误。
(5)公立医院财务人员素质有待提高。
目前，很多医院财务人员政治素质较低，专业知识不足或落后，知识结构更新速度很慢，医院从来不重视财务人员继续教育工作，严重影响了医院财务队伍素质建设。同时，医院的财务管理人员通常还兼任医院的会计核算人员，这必会造成财务人员需花费大量时间和精力，用于医院记账、算账与报账工作上，使财务监督工作难以落实，更不用说财务分析与管理工作了。
(6)公立医院信息化支撑水平落后。
虽然在新医改之后一定程度上信息化网络管理摆脱了传统管理模式的魔掌，但是医院在信息化标准化以及程序和实时化程度还处于中等水平。医院各个信息系统如：终端数据接口等于财务信息通道收集之间没有得到有效的沟通，造成各个信息不能得到共享，造成很多信息各自为政，不能将其融合在一起，致使路径数据不相符等不良现象，给财务管理取数增添了巨大的难度。
二、改善公立医院财务管理的对策
(1)引进精细化管理模式，提高公立医院经营管理水平。
通过对公立医院引进科学管理的体制和运行机制，可以提高医院科学化、精细化管理的水平，有助于优化卫生资源的配置与使用，为提高医疗质量、改善服务能力、规范服务行为、保障医疗安全、理顺补偿机制、完善监管机制、实现公平与提高效率提供支撑手段。因此，在新医改背景下，作为现代医院的管理者，需要将现代医院规范化经营管理的知识应用于医院的管理，提高医院的经营管理水平和决策水平，为人民群众提供安全、优质的医疗服务。
(2)确立全面预算管理战略性地位，强化预算约束。
在公立医院全面预算管理对其重要的意义应当得到医院领导以及各个业务科室的重视，将医院管理的方法策略与预算的编制执行相融合，提高预算编制的财务管理地位。为了保证预算在医院内部得到顺利实施，医院应当制定相应的内部管理制度和办法，提高预算的威慑力。医院相关科室在进行经济业务的时候，应当执行预算，按照预算的规定开展工作。为了保证相应的经济业务按照预算顺利开展，各相关部门必须执行预算。
(3)加强成本控制，提高医院经济效益。
目前政府对医疗机构投入不足，医疗补偿不到位，因此，医院要想提高效益，就应当强化成本控制，降低费用和成本，做到低投入，高回报，但是为了增加医疗市场份额，其提供的医疗服务应当更加优质高效。医院引进全成本核算系统，能对医院所有经济活动支出进行控制与监督，揭示医院经营活动存在的问题，合理改善医院经营管理工作，强化财务管理的管理职能。
(4)做好财务分析和评价，为医院发展规划提供有力的支持。
随着医改的深化，取消药品加成、单病种付费、检查、化验及卫生材料收入占医疗收入比重逐渐下降等一系列举措，对医院的经济运营产生较大的影响。医院资金配置是否合理、大型医疗设备购置可行性论证等问题将直接影响医院的生存与发展，因此通过开展医院资产运营能力、成本管理能力、发展能力及工作效率等方面的分析，能充分揭示医院的财务状况及经营状况，为医院今后的发展规划提供强而有力的支持。
(5)提高财务人员的综合素质。
在医院财务管理体系中财务人员处于主体地位，近些年，由于医院卫生体制的加深，对财务人员的素质有了很高的要求。财务人员不仅要会基本的核算程序，还应当具有职业判断、协调沟通和创新的本领。近些年医院面临的经济环境发生了变化，做医院财务不易，做一名优秀的财务更不是一件简单的事情，医院财务人员需要不断提升自身的业务水平，也需要有敏锐的目光，把握市场的风向标，随时更新自身的业务水平。
(6)建立医院经济运行精细化管理信息系统。
随着医院的信息化进程不断加速，医院数据的海量数据，为医院经济运行分析提供了良好的基础，但仅靠人工处理这些数据几乎是不可能实现的，因此迫切需要一个完整、规范的医院经济运行的精细化管理信息系统，整合、利用这些数据，帮助管理者提升医院经营管理能力，提高医疗服务的效率和效益，增强医疗服务行业的附加值。
三、结论
综上所述，新医改将医院推向了市场化的边缘，医院若要在竞争日益激烈的市场中立于不败之地，就必须加强公立医院财务管理建设，提高医院科学化、精细化管理的水平，增强医院的核心竞争力，保证其健康、稳步地发展。