电子商务也是属于经济发展的范畴，而且近年来电子商务在我国的发展势头迅猛，尤其在服装和电器交易行业，交易额占了经济交易的很大一部分，所以，电子商务的交易本应该纳税的，但是由于电子商务自身的一些特点，给税收的征收造成一定的困难，并且影响税收的查账方式。
1.电子商务在交易完成时一般会形成电子交易的记录和开具的电子发票，而且此电子记录一直是储存在计算机中的，但是在形成纸质账薄时，还是需要手工编织的，这样就给纳税人修改原始的电子记录留下了机会，这样就会造成纳税的不足和漏税的现象发生。
2. 定额征收方式实施困难。电了商务是近年来才逐渐发展起来的，虽然其发展速度非常的快，但是税务机关在征收税费还是比较困难的，电子商务的竞争非常激烈，商家的利润是比较大的，但是确定实际的利润还征收税费还是比较困难的。
3.在电子商务的交易环境下，很多交易都是直接厂家直销，这样减少了商品货物的流转环节，自然的减少了物品流转的费用，随着直接的交易，其税收的监管也慢慢的弱化了，还有就是税务机关要分散大量的人力去征收电子商务交易的税费，给税收管理带来很大的行政成本。这也就是电子商务税收的困难所在。所以，为了实现税收的公平性，国家在电子商务征收税费方面，应加快脚步，创造科学的合理的税费征收的方式。
