近年来行政管理专业的蓬勃发展，招生规模越来越大，得益于经济、社会的开放与发展，这恰恰是因为经济社会领域的简单、粗放的管理，详细内容请看下文民办院校行政管理专业建设的问题。
正是因为行政管理学科的广泛性，以及行政管理专业所培养的目标兼具理论和实用的特点，导致很多有关行政管理专业建设领域的研究成果表明，该专业的学生往往知识杂而不精，能力多而不强，行政管理专业的培养目标模糊等问题出现。
在行政管理专业建设的共性与个性方面，很多研究都集中在普通高校在行管专业的培养内容上，普遍认为共性强于个性是一个主要特点，甚至可以说，对学科共性的关注抹杀了不同院校对专业建设的个性发展。有学者对北京大学、中国人民大学、厦门大学、南京大学4所院校行政管理本科专业的培养目标进行比较，发现培养专业管理人才是每所院校所强调的笼统概念，每个学校并没有根据各学校的师资力量和院校特色，制定出具有特色的培养目标。
对于民办院校而言，与普通高校的培养目标存有不同。民办院校办学必须要抓住自身的特点，行政管理专业的实用性、培养方向的专注应该是其主要方向。就已经设立行政管理专业的民办院校，在专业设置上可能存在更多的问题：
第一，民办院校行政管理专业人才培养的定位不清。从就业市场的反馈来看，民办院校的学生在理论掌握方面不如一本和二本学生，动手能力方面不如高职高专的学生。根据因材施教理论，生源质量决定了人才培养模式，民办学院人才培养到底是套用普通本科还是高职高专的培养模式?在民办院校人才培养层次模糊不清的背景上，民办院校应该培养应用型还是研究型的人才同样难以界定。在对民办学院行政管理学生的教育教学过程中，教育工作者很难把握标准，课程设置也很难准确定位，直接导致教学有效性不高。
第二、行政管理专业特色不明显。国内行政管理专业最早脱胎于政治学，行政管理专业既要兼有政治学的学科内容，又要顾及专业培养目标与职场和社会需求相融合。目前，虽然大部分普通本科院校设立了行政管理本科专业，教学和科研实力较强的院校有行政管理专业硕士点或博士点。普遍来看，很多院校行政管理专业的政治色彩过于浓厚，而对管理规律知识重视程度不够，这一状况，或许导致行政管理专业落后于社会的需要和需求。民办院校在行政管理专业建设中也延续了这一特点。
第三、课程设置不合理。据调查显示，在某民办院校行政管理专业开设的44门主要专业课程中，60%以上的学生认为重要的课程只有：演讲与口才、管理学原理、行政学原理、经济学原理、公文写作和概率论与数理统计，其中90%以上的学生认为重要的课程是演讲与口才和管理学原理，诸如西方行政学说史这些理论性较强的课程仅有不到20%的学生感兴趣。究其根本原因是行政管理在学科设置上并没有考虑到它首先是管理学科，有关管理中对管理问题的处理原则、方法，管理实践具备的调查、统计、信息处理、分析决策等等，这些基本管理知识常识行政管理专业在学科设置中被置于非主要地位的方面。面临的现实问题就是，招聘单位面试的学生都能够侃侃而谈，碰到实际需要解决问题时，如何分析、寻找问题的关键点，以及解决问题的科学方法欠缺。