企业内部审计如何适应现代企业产权制度改革的要求，正面临着一场新的挑战。正确地认识企业改制的形势，发展壮大自己，值得每一个内部审计人员认真地思考。
当前内部审计面临的挑战
由于我国的内部审计是从计划经济过度而来，内部审计的理论、组织，及自身建设等方面都存在不适应当前国企体制改革的要求，主要表现在以下方面：
内部审计理论滞后于实践。近年来，我国的内部审计实践已有了长足的发展，由传统的财务收支审计向内控制度的评审、管理审计等领域拓展，各个单位都在根据自身的特点不断开拓审计范围。但理论滞后问题相当突出：一是审计的基础理论方面，如内部审计的目标、职能、程序和方法等尚未形成一套符合实际的理论体系；二是实务理论方面，如经济效益审计、经济责任审计等方面，理论也落后于实践，可操作性不强，管理审计理论也尚未形成完整的体系；三是国家对内部审计的立法也相对滞后，除审计署的暂行规定之外，还没有一部针对内部审计的立法；四是现行一些理论的可操作性不强，内部审计工作者大都在根据本单位的特点和实际进行探索，内部审计和外部审计无论是工作环境还是工作方法都有很大的区别，因此内部审计要走上法制化、规范化、制度化轨道还有相当一段距离，内部审计的理论研究应当加强。
内部审计组织结构欠合理。一是由于企业领导对内部审计机构建设重视不够，没有设置独立的内部审计机构，有些设置了的又借精简机构之机搞拉郎配，把审计与财务或监察等部门并到一起，个别企业甚至借改制之名撒并了内部审计机构，在人员配备上也是滥竽充数，不但没有把精兵强将放到内部审计岗位上来，而且正常的审计人员数量也难以保证；二是授予内部审计机构的权限不够，有的甚至不予授权，以至内部审计结论的落实难以到位，内部审计发挥不了应有作用；三是审计人员结构不合理，现有的审计人员基本上都是财务人员转型，缺乏经济、工程、法律等专业人员，且审计人员因长年得不到培训而闭目塞听；四是管理体制问题，现在的内部审计直接由企业第一负责人管理的很少，大部分是由总会计师分管，有些甚至由财务总监管理，这种管理体制，严重影响了审计职能的发挥。
内部审计队伍自身建设不完善。一是人员素质参差不齐，有的知识结构老化，不懂现代审计的工具和方法；二是内部审计纪律不严，有些审计人员作风拖拉松懈，参与被审单位吃吃喝喝，形象很差；三是内部审计报告质量不高，应揭示的问题没有揭示，审计建议也不中肯，没有参考和指导价值；四是审计宣传不够，特别是与管理层沟通不够，以至管理层不知道内部审计是干什么的。