菌螨俗称“菌虱”，属节肢动物门，蛛形纲，蜱螨目，是食用菌制种栽培中危害最大的菌害，而且对人亦有危害。其危害情况分三个方面：一是菌螨直接取食菌丝，造成接种后不发菌或发菌后出现“退菌”现象，导致培养料变黑腐烂。二是污染子实体，当出耳阶段即子实体生长阶段发生螨害时，大量的菌螨爬上子实体，取食菌褶中的担孢子，并躲藏栖息于菌褶中，不但影响鲜耳品质，而且危害人体健康。若吃下一定量的菌螨以后，即可引起腹泻等肠道疾患。三是直接危害工作人员，菌螨爬到人体身上与皮肤接触后，将引起皮肤搔痒等症状。其防治方法如下：
1.注意环境卫生。菇房培养室和出菇场地要远离禽舍和粮食、饲料仓库。
2.清除污染源。对于污染或危害严重的培养料要及时处理并清除，同时对污染的环境进行清洁和消毒。
3.烟叶诱杀法。将新鲜烟叶平铺在菌螨危害的培养料面上，待烟叶上菌螨聚集较多时，轻轻将烟叶取下，用火烧掉。
6.油香饼粉诱杀法。取适量菜籽饼研成饼粉，入热锅内，用微火炒至饼粉散发出浓郁的油香味时出锅。在菌螨危害的培养料面上或床面上盖上湿布，湿布上面再铺放纱布，将油香饼粉撒放于纱布上，待菌螨聚集纱布后，取下纱布用沸水烫死。连续诱杀几次，即可达到彻底根治的目的。
7.喷药杀螨法。用0.6%海正灭虫灵3000倍液或克螨特500倍液喷雾杀螨。用洗衣粉400倍液连续喷雾2～3次，也有很好的杀螨效果。