在近两年各级政府采购监督管理部门受理的投诉案件中，供应商直接投诉采购代理机构的案件已占到三分之二，不少采购代理机构在接受这些质疑与投诉中，不仅花费了大量的人力、物力，而且影响了日常采购代理工作的正常开展，因此对于采购代理机构，应正确看待、认真应对质疑与投诉，尽快建立避免质疑与投诉的长效管理机制。
从源头上避免被供应商提起质疑与投诉
采购代理机构严把“采购文件”、“采购过程”、“中标、成交结果”这三个关口，就能从源头上避免被供应商提起质疑与投诉。严把采购文件关，以避免因招标书不合规引起的质疑与投诉。如果采购文件制作人对采购人偏好的理解出现偏差，则很可能会在招标书制作时体现出倾向性；或者对标书的制作不严谨，就会出现差错，从而埋下被不中标的供应商抓住把柄的隐患，提起质疑与投诉。
严把开标现场关 。①监督参与开标的人员是否准时到达开标现场，若有超过开标时间到场的，有无请其退出现场；②检查参与开标的供应商代表的授权委托书，是否与投标书中的授权委托书一致，有无冒名顶替的； ③监督检查启封的投标书是否合符规定程序。是否由投标人或者其推选的代表检查投标文件的密封情况，或者由招标采购代理机构委托的公证机构检查并公证的；是否经确认无误后，由招标工作人员当众拆封，宣读投标人名称、投标价格、价格折扣、招标文件允许提供的备选投标方案和投标文件的其他主要内容。未宣读的投标价格、价格折扣和招标文件允许提供的备选投标方案等实质内容，评标时不予承认。
严把评标定标关，以避免因中标、成交结果不合规引起的质疑与投诉。评标应当遵循下列工作程序：首先，要严把投标文件初审关。初审分为资格性检查和符合性检查。其次，严把澄清有关问题关。第三，严把复核关。对评委的工作底稿要认真履行复核程序，特别是采用综合评分法的，更要认真复核，以防少数人在计算上作弊。第四，严把推荐中标候选供应商名单关。中标候选供应商数量应当根据采购需要确定，但必须按顺序排列中标候选供应商。第五，严把编写评标报告关，以防出现差错。评标报告是评标委员会根据全体评标成员签字的原始评标记录和评标结果编写的报告。
克服“三种态度”，从积极应对上避免因工作不到位败倒在质疑与投诉中
一是克服“怕”的态度，以积极的姿态，做好应对质疑与投诉的准备工作。有些采购代理机构一听到有供应商向他们提起质疑与投诉，就认为这是坏事，就吓得不得了，似乎自己就要受到处罚。对供应商提起的质疑与投诉，应有正确的认识。一方面，被供应商提起质疑与投诉，这是好事而不是坏事，这正是锻炼和提高采购代理机构自身能力的极好机会，有利于采购代理机构规范自己的采购行为；另一方面，被供应商提起质疑与投诉，是难免的。因为，树欲静风不止，总有人会落标，总有人会不满，也必然有人要去提起质疑与投诉，所以，不值得“怕”，应当以积极的姿态应对。
二是克服“糊”的态度，以认真的姿态，做好接受质疑与投诉的答辩工作。所谓“糊”，就是稀里糊涂地对待质疑与投诉。 一定要从参与本次采购的人员中精心选派“能人”，并在答辩会召开前进行模拟训练，使他们不怯场，有充分的思想准备、知识准备、能力准备，以保证其答辩获胜。
三是克服“顶”的态度，以正确的姿态，做好接受质疑与投诉中的整改工作。现实中，有些采购代理机构明知道自已在这次采购活动中有明显的不足与过失，很可能被供应商提起质疑与投诉。按理说，他们接到质疑与投诉后，就应以积极的态度进行整改，从而求得供应商和政府采购监管部门的谅解和从轻处理。可是，他们不是这样做，却是反其道而行之，对供应商提起的质疑与投诉，则是软顶硬抗。不是强词夺理，就是有意设置障碍，阻挠政府采购监督管理部门审理。其结果，只能是错上加错，不仅影响自已的声誉，还会影响本机构业务规模的持续与发展，因此，这些采购代理机构应当坚决克服这种“顶”的态度，以正确的姿态，做好接受质疑与投诉后的整改工作。
加强“三项建设”，从强化管理上筑牢应对质疑与投诉
加强制度建设，从强化规范管理上筑牢应对质疑与投诉的“大堤”。制度就是秩序，有好的制度才有好的政府采购秩序 。这就要求各地采购代理机构要尽快建立以《政府采购法》为核心依据的规章制度体系。
加强标准化建设，从强化采购质量管理上筑牢应对质疑与投诉的“大堤”。众所周知，政府采购本身是一项规范化的工作，作为政府采购程序主要执行人的采购代理机构，更应有规范化的操作规程。也就是说采购代理机构的操作规程要实行标准化。这是政府采购事业发展的必然趋势，也是筑牢应对质疑与投诉“大堤”的重要手段。
加强队伍建设，从强化人员管理上筑牢应对质疑与投诉的“大堤”。人才是采购从业队伍的骨干，是采购代理机构的最大资本，采购代理机构从业人员的技术能力、职业道德水准等直接影响到采购工作的质量，因此，加强队伍建设在当前非常必要，这是采购代理机构全面防止质疑与投诉的基本保证。用先进的科学技术与文化知识来武装采购从业人员，全面提高他们基本的从业素质，其核心是提高他们的政治能力、道德能力、思想能力、文化能力和实践能力，使得每个采购从业人员都有过硬的业务能力，以使采购能力形成巨大的量的积聚和涌动，这将对防止质疑与投诉起到最根本最深远的作用和影响。二要结合实际，加强培养。要紧扣当前政府采购工作的实际问题，对采购从业人员进行全面的培训。使他们尽快成为业务内行、管理精英，创新能手、发挥最大的人才管理效力。三要实现采购从业人员的全面发展。要充分利用现有的人力管理资源，促进采购从业人员自勉自励、自我促进、自我实现和全面发展。促进采购从业人员加强自学和自我修养，脚踏实地提高自身素质，特别是在道德、自警、自律等方面的职业素质和在政府采购管理、操作等方面的能力素质，实现采购从业人员自身的全面发展与完善，从而构筑起应对质疑与投诉的牢固“大堤”。