“如果李登辉表示没有‘九二共识’，那请问这位是谁？”5月7日，马英九出席一个展览时，指着一份文件上李登辉的签名向记者们反问道，流露出其少有的坚决表情，并有些许生气的神情。
会议记录中称，会议通过了关于“一个中国”的涵义的解释，即“海峡两岸都坚持‘一个中国’的原则，但赋予的涵义有所不同”。但李登辉随后接受访问时表示，这个会议是台湾内部的会议，追求统一是对国民党元老们讲的话，不是和大陆讲的话。
在此之前，李登辉就曾多次表示“九二共识”并不存在，并认为“九二共识”是大陆和国民党自己编造出来的东西。5月初，中共中央总书记习近平在北京会见了国民党主席朱立伦，双方再次强调了“九二共识”的重要性，重申“九二共识”是两岸交流的政治基础，不容挑战。
“习朱会”之前，两岸舆论最为关注的便是双方是否重申或发表超越“九二共识”的内容。朱立伦是2005年以来，继连战、吴伯雄后第三位登陆的国民党主席。两岸破冰以来，国民党主席中只有马英九因种种原因未曾登陆。
抢在朱立伦登陆前的敏感时刻，马英九于4月29日前往“陆委会”视察，再次强调了“九二共识”的重要性，表示任何其他的主张都不能将其取代。
马英九表示，“九二共识”就是为两岸最敏感的“一个中国”问题找到了一个双方都能接受的政治基础，达成了难得的政治交集，双方都要用心珍惜，不要偏离。
在马英九和朱立伦等纷纷强调“九二共识”之后，在台湾针对该共识存在已久的争议再度被挑起。
而在2005年之前，大陆官方一直坚持“一个中国”政策，并未公开强调“九二共识”的说法。直至连战登陆之后，国共双方才正式宣称将“九二共识”视作是两岸交流的共同政治基础。
“最早提出这个名词是想缓解民共矛盾，我当时也没想到‘九二共识’会被中共接受，现在的现状反倒是民进党不接受。”苏起表示。
台湾政治大学国发所所长、曾在陈水扁执政时期担任“陆委会副主委”的童振源教授认为，国共两党在“九二共识”上是没有共识的，国民党认为的“九二共识”是“一中各表”，但中国大陆则认为“九二共识”的内涵是“一个中国”。“实际上，2008年以来两岸政治交流的政治基础是‘九二共识、各自表述’，或者干脆称为‘零八共识’”。童振源的看法代表了部分绿营政客的主张，是李登辉、陈水扁立场的变相表达。
虽然台湾岛内蓝绿阵营之间对“九二共识”的认知存在分歧，但“陆委会”最新民调显示，台湾岛内对“九二共识”的支持率依旧超过50%。大陆方面也一再表示，“九二共识”作为两岸交流政治基础绝对不能动摇。
2012年之后，虽然有不少民进党政治人物登陆访问，但鉴于“台独党纲”和拒绝承认“九二共识”，民进党与共产党之间一直没有进行党对党交流。多个信息源对《凤凰周刊》声称，民进党曾多次私下表示与大陆进行党际交流的愿望，但均被大陆拒绝。
不过岛内“反中”声浪依然不小，很有希望在明年问鼎“大位”的蔡英文却在“九二共识”上愈加谨慎。在宣布竞选纲领时，蔡英文表示对“九二共识”既不承认也不否认，态度相较以前有了相当大的缓和。也有传闻称，在“陆委会”工作多年，对大陆对台工作十分了解的蔡英文认为，大陆会随自己的当选而放松对“九二共识”的坚持。但从大陆方面的表态来看，对“九二共识”的坚持绝无松口的可能，毕竟除“九二共识”之外，两岸之间尚未构建出任何可以取而代之的政治基础。