一、对审计线索的影响
审计线索对审计来说是极为重要的。在手工会计中，审计线索包括会计凭证、账簿、报表等会计资料。这些资料都反映在书面上，审计人员利用这些资料就能够从原始凭证开始，通过记帐凭证、帐簿追踪到会计报表，或者对报表之间、报表与帐簿之间的会计数据的勾稽关系进行审查，通过这些可见的审计线索检查证、帐、表数据所反映的 经济 业务的合法性，通过每个会计人员手写笔迹的不同，确定每一责任人完成业务的正确性。总之，在手工会计中，会计人员对经济业务的详细记录都跃然纸上，审计人员所需的审计线索，都可以通过这些书面记录加以审计。审计人员进行审计，完全可以根据需要进行顺查、逆查或抽查。但是，在电算化会计中，计算机的使用改变了会计记录的存储与处理，表现在以下几方面。
1.会计凭证的存储与处理。原始凭证或记帐凭证一经输入计算机，便以文件的形式存入机内的数据文件。并且原始凭证一旦转换到机器可识别的输入介质上，就不再在数据处理过程中使用；在某些系统中传统的原始凭证可能由于采用直接采集数据的设备而不复存在（如在联机实时处理系统中即如此）。
2.帐簿的存储与处理。总分类帐为文件所代替，而在主文件中可能看不出计算汇总数据所依据的明细数据。明细分类帐采用满页打印方式，因而导致两类数据之间的日常核对只能在机内进行。帐簿登录时，通过计算机登帐程序自动执行，使用的是哪一种记帐程序难以判断。
3.报表的编制采用按事先定义的公式到帐簿文件，其它报表文件中取数计算、数据来源、公式定义、编制结果、打印格式等均采用机内文件的形式。由于磁性介质修改不留痕迹的特点，使审计人员很难相信打印输出的会计报表正是根据 企业 单位提供的公式定义文件加以编制的。假如有人在歪曲公式定义文件之后编制失真的财务报表，然后对公式定义文件复原，在这种情况下，审计人员便不能根据机内的公式定义文件作出判断，认为报表的编制是正确的。
以上种种情况表明，由于计算机采用磁性材料作为存储介质，处理过程都在机内文件之间进行，因而使审计人员难以像在手工操作环境下那样对经济业务进行追踪审查。因此，电算化会计信息系统设计时要注意留下充分的审计线索，使审计人员在电算化条件下也能跟踪审计线索顺利地完成审计任务。在现阶段，尽管财政部在有关会计电算化制度中规定，所有凭证、帐簿、报表仍然应当打印输出，使审计人员在审计工作中增加了审计的线索，但应当看到的是，这些书面的记录是否与会计软件的正确处理结果同出一辙，尚有待于进一步的验证。
二、对审计 内容 的影响
在会计电算化的条件下，审计的经济监督职能并没有改变。但由于会计电算化信息系统的特点及其固有的风险决定了审计的内容要发生相应的变化，包括对计算机处理和控制功能的审查。这是在传统的手工审计中所没有的。因此，电算化会计信息系统的审计内容就应当包括系统的开发与设计、会计软件的程序、数据文件以及内部控制的审计等。
在电算化会计信息系统中，由于会计事项由计算机按程序自动进行处理，诸如手工会计中因疏忽大意而引起的计算或过帐错误的机会大大减少了。但如果系统的 应用 程序出错或被人非法篡改，则计算机只会按给定的程序以同样错误的 方法 处理所有有关的会计事项，错误的结果将是不堪设想的。系统也可能被神不知、鬼不觉地嵌入非法的舞弊程序，不法分子可以利用这些舞弊程序大量侵吞企业的财物。系统的处理是否合规、合法，是否安全可靠，都与计算机系统的处理和控制功能有直接关系。在会计电算化条件下，审计人员要花费较多的时间和精力来了解和审查计算机系统的功能，以证实其处理的合法性、正确性和完整性，证实系统的安全可靠性。对计算机系统本身的审查，要求审计人员具有计算机及电算化会计的知识和技能。
确定内部控制的可依赖程度，根据符合性测试与评价的结果，对下一步审计计划和审计程序加以调整、补充或修订，不仅手工审计要这样做，即便是电算化会计系统的审计也是如此。只是由于电算化会计系统内部控制的内涵与外延的扩大，以及内部控制的程序化，致使电算化会计系统的内部控制审计显得更为重要。
三、对审计技术的 影响
在手工会计的条件下，审计可根据具体情况进行顺查、逆查或抽查。审查一般采用审阅、核对、 分析 、比较、调查和证实等方法。所有这些审查工作都是由人工执行的。这就是传统的手工审计的方法。在会计电算化条件下，审计的对象发生了变化，如果仍然采用常规的手工系统的那一套审计技术，就不可能达到审计目的。由于审计 内容 扩大到电算化系统程序、系统的设计与开发、数据文件与内部控制等方面，迫使审计人员在采用传统的各种审计技术的同时，也采用 计算 机辅助审计技术，用日益先进的计算机审计软件去对付单机、 网络 、多用户等各种工作平台下的会计软件。
另一个计算机辅助审计技术的 应用 是，在电算化会计信息系统的设计开发过程中，可事先在被审的计算机系统中嵌入审计程序。这些程序可以执行审计监督，建立审计跟踪文件，记录符合指定条件的会计事项及其操作处理的有关信息，以便日后审计人员跟踪追查。这些程序也可以执行一些特殊的审计功能。
四、对审计标准和准则的影响
人们在以往的审计工作中已建立了一系列的审计标准和准则，如审计人员标准、现场审计标准、审计报告标准、职业道德规范、审计效果衡量标准、财务审计准则、 经济 效益审计准则等。但是，由于审计对象、审计线索、审计内容以及审计技术手段等发生了一系列的变化，手工审计中所制定的审计标准与审计准则也就很难适用。但在电算化会计这样特定的工作环境中所出现的新情况和可能产生的新问题，又必须有一套与之相适应的新的审计标准和准则。在我国，由于经济立法往往是在经济事项充分 发展 之后，而计算机审计工作又刚刚起步，因而计算机审计的标准和准则发布不多。如电算化审计人员培训考核标准，电算化管理信息系统开发审计准则及其内部控制审计准则，审计应用软件标准等等都有待建立。
五、对审计人员的影响
由于电算化管理信息系统的环境比手工处理的管理信息系统更为复杂，因此，审计人员面临着更新知识的需要，他们不仅要具有丰富的会计、财务、审计知识和技能，而且应掌握一定的计算机知识及其应用技术，还要掌握一定的 现代 信息处理和管理技术；不仅要懂得审计软件的操作方法，而且还应根据审计过程所出现的种种问题即时编写出各种测试、审查程序模块。从长远的观点看，审计人员还应当掌握编写适合各种场合需要的审计软件，建立起自己的电算化审计系统。
