开展财政资金扶贫，提高农村财政扶贫资金的利用率，则无疑又是强化农村扶贫工作最为重要的工作之一。由此，规范农村财政扶贫资金的管理、使用和运作，自然也就成为了我国当前和未来做好农村扶贫工作关键之关键。那么，在这样的情形下，我们究竟应该如何认识农村财政扶贫资金管理存在的问题并针对性地加以解决呢?
农村财政扶贫资金管理中存在的突出问题
农村财政扶贫资金管理理念滞后。传统财政救济式的扶贫方式仍然占据主导地位，没有从根本上解决农村贫困人口问题。在对农村扶贫资金的管理中，侧重于从农业发展角度制定各种扶贫资金管理计划。简言之，目前的农村扶贫资金管理主要是围绕农业和土地展开，没有建立更加广泛的农村扶贫计划。广大农村地区的居民已经开始改变以往传统农业生产生活的方式，树立起更加积极的职业理念。不少农村地区希望通过政府的财政扶贫帮助提高自己的致富能力。但是，我国目前农村财政扶贫资金还主要是对农村居民生产生活进行直接的财政补贴，而很少采取帮助农村地区居民提升其获得收入的能力。有人形象地把这种扶贫方式称为输血式扶贫，其只是暂时缓解部分农村居民的贫困状况，没有从根本上解决农村贫困问题。①地方财政部门在扶贫资金的管理与使用中，把本就有限的扶贫资金用于生产效率较为低下的农业生产项目中，没有建立更加全面科学的多行业扶贫资金使用方式。这种传统的扶贫资金管理与使用方式，不但是对有限的扶贫资金的浪费，更不利于农村地区长远健康的发展。
扶贫资金绩效考核方式过于单一，没有制定出全方位、多元化的考核评价方式。我国目前在对地方扶贫资金的财政转移支付中，一般采取通盘考量各省扶贫人数、农民收入等具体因素进行财政扶贫资金的差异化拨付。
在对扶贫资金的绩效考核中，也主要依据各省上报的扶贫人数损益情况进行考核评估。这种简单的考核方式，并没有真正看到不同农村地区贫困人口的实际变化情况，这就使得目前我国地方扶贫资金的考核评价标准逐渐与农村地区扶贫工作的开展相互脱节。有些地方政府在农村扶贫工作中，侧重于农村宏观经济目标的实现，忽视对农村地区生态环境保护。这种片面追求经济GDP增长的扶贫理念，降低了扶贫资金的使用效率，最终不利于我国农村地区的长远发展，也对我国目前大力推进的生态文明社会建设产生相应的负面影响。
农村财政扶贫资金管理制度不健全。财政扶贫资金的筹措制度不健全。目前我国各项财政扶贫资金主要是来自于中央对地方的专项财政扶贫资金拨付和地方自己的财政收入。数据统计显示，2013年我国地方财政扶贫资金来源中，85%以上来自于各级财政，有的地方扶贫资金全部来自于财政专项扶贫补助资金。②虽然一些地方政府已经开始采取社会化融资方式，弥补扶贫资金的缺口。但是，采取这种资金筹措方式毕竟还缺乏国家层面的更加细致的法律政策的扶持。因此，从未来很长一段时间看，我国农村扶贫资金还是以财政补贴为主。③如果农村扶贫完全依靠政府财政扶持，长期以往不但会增加政府财政负担，同时还对其他社会资金进入农村扶贫产生一定的资金壁垒作用。加上地方财政扶贫资金频频爆发贪污和挤占挪用的现象，这使得相当一部分财政扶贫资金并没有真正发放到农村贫困居民的手中。因此，我国目前农村扶贫资金筹措渠道太单一，筹措制度不健全，管理不规范等问题将会对我国农村扶贫事业的开展产生不利影响。
财政扶贫资金使用规范制度不健全。虽然政府多次强调了农村扶贫资金应专款专用，严禁财政扶贫资金使用不规范、不合规甚至弄虚作假现象的出现。但是，从我国地方农村财政扶贫资金的实际使用效果看，扶贫资金渗漏现象非常严重。尤其是随着更多农村居民离开家乡前往城市打工，在广大农村地区留守儿童、空巢老人现象越来越多。若对这些农村弱势群体进行专项财政扶贫，投入资金数量和扶贫效果则不成正比。除此之外，单纯侧重于经济发展，忽视环境生态保护的现象也逐渐凸显，这就使得我国农村地区贫困人口的财政扶贫工作开展举步维艰，农村地区脱贫又返贫的现象层出不穷。
财政扶贫资金监管制度不健全。我国目前采用的财政扶贫资金的监管制度，还主要是依靠政府相关监察审计部门来进行，广大财政扶贫的受众―农村居民对财政资金的筹集、使用等并没有真正的知情权。如地方在发放财政扶贫专项资金中，一般由地方财政部门委托地方扶贫办专门负责，由地方发改委监察审计等部门负责监管。虽然层层部门监管，一定程度上保障了财政扶贫资金不被挤占挪用，让这些有限的资金真正用于农村亟需的扶贫事业之中。但是，财政资金审批程序繁多，审批时间过长等问题容易让一些不法分子钻空子，造成扶贫资金挤占挪用等现象还比较突出。
广大农村地区居民缺乏对扶贫资金的知情权和管理参与权，这使得我国农村地区财政扶贫资金的利用效率非常低下。③同时，有的地方政府采用的财政扶贫资金监管制度多是沿用上级政府制定的各种宏观政策法规，没有结合自己地方财政扶贫工作的特点，这也是我国当前地方财政扶贫资金监管中存在的普遍性问题。
农村财政扶贫资金在运作管理中问题丛生。目前我国政府在农村扶贫资金运作中暴露出很多问题，如资金运用效率低、资金流失严重等。造成这种问题的主要原因在于农村扶贫资金运作管理模式自身存在很多漏洞。
首先，农村财政扶贫资金在拨付中，会受到从上至下利益关联部门的层层盘剥，有的地方政府扶贫部门会把一部分地方财政扶贫资金截留作为自己单位的福利资金发放给下属工作人员。