一、事业单位会计制度的改进和特征
新的事业单位会计制度在以下几个方面实现了改进：
(一)在体系上进行独立
事业单位会计制度和行政单位会计制度相对分离，自成体系。在市场经济发展过程中，原有的事业单位会计制度和行政单位会计制度合并的会计制度已经不再适应时代发展要求，事业单位的会计实务越来越向着企业会计制度趋同，而行政单位会计制度依然停留在财政拨款的层面上，在本质上执行的依然是预算会计制度。新的事业单位会计制度渐渐和企业会计制度趋同。
(二)新的事业单位会计制度变革了会计记账方法
新的事业单位会计记账方法从收付实现制变为了权责发生制，权责发生制是一种符合市场经济发展需求的记账方法，权责发生制能够通过账户科目设置、记账规则的规定和试算平衡来满足市场经济发展情况下的会计核算要求。
(三)统一会计科目
在新颁布的制度中，将全额、差额以及自收自支这三套会计科目摒弃了，编制了一套高效的事业单位通用会计科目的《事业单位会计制度》，新制度中通过统一的会计科目进行核算，大大增强了单位会计数据的可比性。
二、事业单位财务会计制度下财务审计应该关注的重点
(一)应该关注期初余额
在新的事业单位会计制度执行之后，相关规定已经明要求事业单位应该将原事业单位会计制度下的科目余额进行调整和整顿，科目余额经过调整之后还要进行试算平衡，调整后的期初余额应该作为新事业单位会计制度执行过程中各个会计科目的期初余额来处理。财务审计过程中，审计人员应该关注期初余额的审计，比如其填列的方法，调整的原则等等，举例来说，新事业单位会计制度设置了应付职工薪酬账户科目，该账户包括了原事业单位会计制度中的应付工资、应付其他个人收入、应付地方或部门紧贴补贴，同时还包括了在其他应付款二级科目核算下的住房公积金和应付保险费等科目。这样的会计科目需要审计人员对期初科目余额的调整进行全过程的检查和动态的分析，在了解事业单位实际状况的基础上，通过控制测试和实质性程序来认真分析事业单位可能在某个会计科目中存在的舞弊现象，并制定相应的审计程序进行应对，从而避免舞弊和错误。
(二)应该关注固定资产折旧和无形资产摊销的核算
新的事业单位会计制度允许事业单位计提固定资产折旧和无形资产摊销。对于新的事业单位会计制度在实施之前就存在的固定资产，应该认真核实、监督，对其原价进行认真仔细地核查。截至到2013年12月31日的固定资产，应该对其进行技术分析和使用程度检测，估算其尚可使用的年限，核对其已经使用的年限，并在这一年的最后一天进行固定资产折旧的补提。2014年事我国新事业单位会计制度执行之日，从这一天起固定资产开始按月计提折旧。新事业单位会计制度执行后的固定资产应该从固定资产购买或者安装使用后的次月起进行折旧的计提。无形资产在账务处理上和固定资产基本上是相同的，审计人员在执行审计工作的时候应该重点关注固定资产和无形资产的原价、尚可使用的年限以及尚可摊销的年限，确保固定资产和无形资产在账面价值上的合理性。
(三)要关注在建工程核算工作
事业单位新的会计制度中增设了在建工程会计科目，事业单位需要将基建工程明细科目纳入到在建工程科目核算。审计人员在审计过程中，应该确保其明细科目余额核算正确，按照会计制度定期地、严格地将基建数据并入到大帐之中去，另外，审计人员还要对明细科目本期发生额进行精确性的核算和全面核查。
(四)要关注是否构筑良好的内部控制环境
内部控制环境的好坏对事业单位会计制度的实施状况有直接的影响，内控环境可以让特定的控制增强或者削弱。内部控制薄弱的话，那么事业单位可能会启用胜任能力不足或者职业道德不够的会计人员，那么势必会导致事业单位的控制难以实施或者趋于失效。笔者认为事业单位的领导层应该重视起来，管理者如果不愿意或者不注重内部控制的建立、不遵守内部控制制度，那么员工也不会注重内部控制制度的权威性。另外，事业单位应该注重财政资金集中收付制度的建立，增强对公开支出的权限控制，对工作人员进行培训和职业道德教育，审计人员在审计的时候应该关注事业单位内部控制的建立情况。
(五)要关注应收应付科目的核算工作
新事业单位会计制度使得绩效审计获得了发展的空间，部分事业单位越来越关注经济指标和绩效考核指标的实现，往往会在应收应付项目上进行弄虚作假，审计人员应该重点关注应收应付项目的完整性和真实性，实施实质性分析程序，对财务数据进行分析，查找其不正常的项目，在审计的时候关注其核销手续是否完备、核销证据是否充足进行详细的检查，运用先进的审计技术手段来降低审计风险。
事业单位新的会计制度已经全面落实，相关的审计工作和审计人员应该跟上时代的步伐，了解事业单位会计制度和会计准则的实施要点，并根据事业单位会计实务来关注审计工作的重点。要关注期初余额、固定资产折旧和无形资产摊销的核算、在建工程核算工作、是否构筑良好的内部控制环境、应收应付科目的核算工作。
