经济责任审计的运行机制是指在经济责任审计工作的开展中，影响审计工作开展的因素以及这些因素产生影响、作用原理、发挥功能的作用过程及其运行方式。科学合理的经济责任审计机制对工作起积极的推动作用。
一、经济责任审计运行机制的特征
1. 审计执行机制方面的特征。经济责任审计执行机制方面的特征主要体现在审计内容上。党政主要领导干部经济责任审计的主要内容包括财政收支责任、国有资产管理责任、政府债务责任、政府投资重要项目管理责任以及对直接分管部门的管理和监督责任，应关注的内容包括发展责任、法律法规政策执行责任、重大经济决策责任、经济社会环境效益责任以及廉政责任。可以看出，经济责任审计同其他类型审计相比在审计内容上有着自身的特征。经济责任审计的内容不仅强调资源使用的经济性、效率性和效果性，而且强调组织的发展责任、国家政策制度执行责任、国家经济安全责任以及廉洁自律责任。
2.审计动因方面的特征。
（1）经济责任审计动因解释之公共行政行动观。经济责任审计与其他类型审计相比，具有一个重要特点，即审计对象为特定的行为人，而非特定的组织。经济责任审计对象为何直指组织中具有特定职务的行为人，就是因为具有特定职务的行为人对组织负有个人责任。以公共受托责任理论和公共行政的行动理论为依据，可以认为担任特定职务的领导干部也间接负有公共受托责任，并同时对集体决策的行为负有个人责任。承担公共受托责任的特定行为人，即领导干部，也应通过审计来确认和解除他们的公共受托责任，从而成为审计对象。
（2）经济责任审计动因解释之民主政治观。①加强党风廉政建设需要对领导干部进行经济责任审计。经济责任审计对党员领导干部的经济责任履行情况进行审计，其实质就是对党员领导干部的公共权力运用情况进行审计，有利于加强对领导干部权力运用情况的监督，形成对领导干部权力使用的有效约束，防止公共权力的滥用，从而有助于促进党员干部的廉洁自律。②建立健全行政问责制需要对领导干部进行经济责任审计。实施行政问责制就需要对领导干部的责任进行确认与解除，而经济责任审计产生与发展的本源使命就是对领导干部的经济责任进行确认与解除。经济责任审计通过对领导干部经济责任的履行情况进行监督，可以成为对官员进行行政问责的一种有力手段。③完善领导干部选拔任用制度需要对领导干部进行经济责任审计。完善领导干部选拔任用制度需要建立一套科学合理的领导干部业绩评价体系。经济责任审计通过对领导干部经济责任的履行情况进行评价，可以较为全面地了解领导干部履行职责的能力，从而为选拔、任用领导干部提供依据。
3.审计委托机制方面的特征。审计基本理论认为，审计委托关系包括三方主体，即审计人、被审计人、审计委托人。审计委托人为资源或财产的所有者，被审计人为资源或财产的受托经管者，审计人为确认和解除财产或资源所有者与财产或资源受托经管者之间受托经济责任关系的独立第三方主体。经济责任审计在委托机制方面的特征主要体现在审计关系上，即党委部门成为审计委托人。《宪法》规定：一切权力属于人民，人民为公共财产和资源的所有者；人民代表大会代表人民行使权力。根据审计关系人理论，审计委托人为财产或资源的所有者。因此，经济责任审计的委托人可以分为三个层次：第一层次委托人是全体公民；第二层次委托人是人民代表大会；第三层次委托人是各级政府。在我国经济责任审计实践中，经济责任审计委托人既包括政府部门，也包括党委部门。党委组织部门和纪检部门是党管理干部的重要部门，经济责任审计的对象不仅包括政府及其部门领导干部，还包括党委领导干部，其审计对象的范围具有特殊性。党委部门成为审计委托人符合我国的国情和经济责任审计的实践情况。
二、完善经济责任审计运行机制的意义
1.有利于客观评价经济责任审计工作的履行情况。建立健全经济责任审计机制，重视审计人员的考核与评价，有利于增强审计人员遵纪守法的自觉性，从而依法办事，保证审计人员按法律法规开展审计工作，保证审计结果的准确性和真实性，从而保证政府及时掌握我国经济的发展状况。
2.有利于促进干部勤政廉洁，规范干部行为。经济责任审查，是对一些经济利益和财务管理进行审查，这不仅可以发现经济发展过程中存在的问题，还可以发现其间存在的干部的违法乱纪行为。在处理审查结果时，不仅对经济问题进行处理，还要对作风问题进行审查。经济责任审计机制有利于促进干部勤政廉洁和规范干部行为，有利于我国经济健康持续发展。
3.有利于完善干部激励与约束机制，正确评价和选聘干部。其一，明确了审计人员的责任和义务，对审计人员的行为有了规范和约束，从而促进审计工作的正常有序地开展；其二，可以了解审计工作开展的状况，对审计工作作出有效性地评价，做到奖惩有度。这对审计人员来说既有了行为的约束，同时又有了做好审计工作的动力。总之，能够为审计人员提供参照的规章制度，可以有序地开展工作。
