2011年5月，侯世科履新武警附属医院院长。在上任后的第一次院周会上，侯世科与大家共勉卡里？纪伯伦的名言：不要因为走得太远，以至于忘记自己为什么出发，理性提出“医院在快速发展进程中要适时放慢脚步，重视内涵建设”。时隔两个月，他提出“二次创业”，引领武警附属医院踏上新的征途――利用十年建成国内军内一流现代化研究型医院。
谋定“十年目标”
从临床医学专家变身叱咤国际、国内灾害医疗救援战场统帅，再成为医院管理者，两次转型、特殊阅历赋予侯世科有别常人的胆识、智慧与魄力。
甫一到任，摆在他面前的是难逢的机遇与现实的挑战。医院刚刚被授命组建国家级医疗救援队、被纳入天津市“十二五”期间八大重点建设医学中心、被列为天津市三所自助挂号和网上预约试点单位之一，面临学院医院“两院整合”、东丽湖分院建设等发展契机，然而扭转人才短缺断层、资金严重不足、思想观念陈旧困境的重任同样迫在眉睫。
创业者不乏激情，更需要善思善变、谋定而后动。经过与军内外大型医院比对分析，经由科学梳理医院良性发展的瓶颈问题，2011年7月，侯世科确立了“一二三四五”的医院总体发展战略：建成国内军内一流现代化研究型医院，始终坚持“姓军为民”、“质量建院”两个原则，注重统筹军事、社会、经济三大效益，建好医疗、护理、管理、保障四支队伍，实施理想、目标、责任、荣誉、待遇五项激励。
得益于十余年的跨越式发展，武警附属医院已跻身国内、军内中游行列，侯世科笃定，“利用十年时间建成国内军内一流现代化研究型医院，发展特色学科、龙头科室，拟建成至少5个‘院中院’，以强带弱，带动医院全面发展。”
美好的愿景不可能一蹴而就。侯世科将它拆解为三步，力求递进式螺旋发展。第一阶段，利用3年时间实现天津市一流医院的初期目标，届时部分学科在国内占据翘楚地位，折桂全军、天津市重点实验室。第二阶段，再用3年落地的两院整合、分院建设将使医院面貌翻天覆地，神经内外、心血管、救援医学三大国家级重点学科基础上，呈现呼吸、骨科、妇产、消化、烧伤、肿瘤等潜在优势学科有序竞争发展，“院中院”构架搭建完毕，达成环渤海地区一流医院的中期目标。第三阶段，在夯实医院规模、平台效应、学科实力的前提下，推行外部整合与内部融合，问鼎国内军内第一方阵。
2011年，侯世科领衔的救援学科被评为“全军重点学科”。
2012年底，新脑科大楼投入应用使医院开放床位扩容至1800张，创建用于批量伤员救治、执行医疗保障任务的方舱医院问世。
2013年，启动武警后勤学院老校区改造新建门急诊大楼和东丽湖分院建设，心血管内科学实验室获批天津市心血管重塑与靶器官损伤重点实验室，灾害应急救援实验室高分通过全军重点实验室评估验收，心理救援队被国家红十字总会定格为国家级心理救援队。
2014年，继中国武警脑科医院、中国武警心脏医院，第三家“院中院”――天津市东方妇儿医院挂牌。
恪守“质量建院”
如愿完成十年规划的初期目标后，全院热情高涨，力主借势乘胜追击，希望拆除学院原机关楼、图书馆、宿舍楼并利用两三年时间建成一所日门诊量8000人次的现代化门急诊大楼，应与天津市东方妇儿医院、东丽湖分院改建一气呵成。
但是，侯世科深知，“两次大规模战役之间往往需要一段时期缓冲休整，再次蓄积实力”。尤其对于一家正处于快速发展轨道上的医院，速度与质量的残酷博弈往往让医院管理者患得患失。侯世科的“质量优先原则”却在任何时候都不曾被动摇。
这并非一句空话。2014年是国家、军队全面深化改革的启动之年，亦成为医院大力加强内涵建设、加快推进转型发展的攻坚之年，他在“基础建设、卫勤建设”基调上更为突出“内涵建设”和“作风建设”。在侯世科看来，内涵建设是增强医院综合实力和竞争力的关键支柱，“抓住了内涵就抓住了发展的根本”，它事关“质量建院”的根基。“两院整合”工程生生推迟半年开工。
质量是大到国家、社会，小到医院发展的永恒话题。作为部队医院的掌门人，更多了一份确保军事效益的天职。侯世科的逻辑是“既要讲经济效益，也要讲社会效益，更要讲军事效益；以军事效益提高社会效益，以社会效益带动经济效益，以经济效益促进军事效益，三者形成一个有机整体”。
“必须提到战略高度，要实现医院在质量建设上的突破，首要抓人才建设，从人才要出路，努力打造人才方阵”。
按排履职后不久，侯世科积极推行“三个一”人才战略：引进一批高层次的学科带头人，努力推动薄弱学科建设发展；提拔培养一批优秀中青年技术骨干，调整充实到科室领导岗位，进一步增强科室领导队伍活力；聘用一批科室一线岗位工作人员，满足基本医疗工作需求，调动一线岗位人员积极性。这为“研究型科室-优势学科群-研究型医院”建设思路铸就人才基石，也成为质量建院提供最坚实的要素保障。
成大事者必作于细，得其大者可以兼其小。侯世科坚信，“医院要脱胎换骨，必须从基本得不能再基本的事情‘补课’，从一人一事做起，从一页病历、一次接诊、一次操作、一次护理做起。每个细节都做好了，整体质量就上了一个大台阶。”
