运输船舶大型化趋势促使港口作业离岸化、深水化。这也同时导致了中国港口建设的“井喷”，然而，吞吐能力过剩、同质化竞争严重和集疏运体系不完善是各港口目前正在遇到的难题，犹如“三座大山”，抑制了本就进入增长放缓期的港口发展。
高速增长不再
在10月底召开的“第十四届中国港口航运物流展览会”上，张小文等众多专家指出，中国港口企业的高速增长期已经一去不复返，“十三五”期间，港口货物吞吐量将由快速增长转入中速个位数增长阶段，呈现吞吐量净增量、年均增速“双下降”趋势。
吞吐能力过剩
港口产能过剩将导致港口企业盈利能力下降。中国交通建设股份有限公司副总裁朱碧新表示，由于“十一五”、“十二五”期间全国港口投资过于集中且投资总额过大，特别是受国际金融危机影响，已从原来的压船、压港转为严重的产能过剩，港口企业盈利能力下降。
同质化竞争严重
国家发改委综合运输研究所副所长汪鸣指出，众港口之间重竞争轻合作也是导致港口整体产能过剩的主要原因之一。按国际标准，200千米以内不应有同等规模的港口，但是，在中国沿海却是平均50千米就有一个1000吨级以上规模的大港口。同一港口群之间相互竞争，类似“窝内斗”。
张国华表示中国港口同质化竞争突出，将导致货物分流严重。同一港口群内港口功能重合，设施建设重复，内部消耗严重，削弱整体对外竞争力。朱碧新指出，中国港口布局同质化现象严重，导致岸线、集约性利用水平不高。目前，中国港口扩张占用岸线的发展模式仍显粗放，局部地区港口建设过热，岸线利用没有统筹考虑，造成港区空间布局同质化，影响岸线和环境资源的有效利用。
集疏运体系不完善
如果说在阻碍中国港口发展的因素中，同质化竞争属于主观因素，那么集疏运体系不完善则属于客观因素。张国华指出，中国港口集疏运体系不完善，表现在港城互动弱，沿海带动内陆不足；集疏运依赖公路，腹地狭小。以天津港为例，天津港货源中的65%来自京津冀，35%来自其他腹地；集装箱货源中82%来自京津冀，18%来自其他腹地；而其集疏运体系中，67%的货物依赖公路运输。由此，天津海铁联运方面的劣势赤裸裸地展现出来，与国外集疏运体系成熟的港口相比，天津港海铁联运量所占比例几乎少得无法“遮羞”。
