一、实施会计集中核算制度对内部审计工作的影响
（一）正面影响
1、有利于提高内部审计工作效率。实施会计集中核算后，夯实了会计基础，提高了地区财务管理水平，进一步加大了对财政性资金的监控力度，单位资金的使用管理由以前的事后监督转为事前、事中、事后的全过程监督，有效遏制和纠正了不合法凭证和不合理开支，由些会计监督职能得到强化，会计信息质量得到提高，从而有利于提高内部审计工作工作效率，降低内部审计风险。
2、有利于减少审计成本，突出审计重点。会计核算中心集中了各基层单位部门的会计资料和信息，内部审计部门通过会计核算中心可花费较少的审计成本就可以对各单位实施内部审计工作，有利于确定审计重点，有利于确定宏观 分析 和全面评价。
3、有利于“小金库”的确认和制定。实施会计集中核算后，各中心的行政事业单位所有银行账户均被撤销，所有资金全部纳入核算中心，因此凡是没经批准遗留和新出现的账户和资金都应视为“账外账”，“小金库”。
（二）负面影响
1、资金载体发生变化使内部审计客体增加，增大了责任认定的难度。在会计集中核算制下，资金载体发生了变化，内部审计部门与被审计的单位，部门之间增加了会计核算中心因而审计对象由单一被审计单位变为被审计单位，部门与会计核算中心两个客体，被审计单位，部门的会计核算工作虽然转移，但依然享有财务收支执行权，财产物质管理权，收入的筹集，支出的审批权，仍然是财务收支有关的 经济 管理的实体，也必然是被审计的主要客体，而核算中心成为审计的又一客体，是因为被审计单位的会计职能，会计核算，会计监督都由会计核算中心完成，并行使会计资料档案保管权力及资金管理权，因此在核算中心与被审计单位部门之间可能就一些会计核算责任 问题 相互推诿，以及要在两客体间来回查阅和问询辨认，增大了一些认定难度。
2、准则规范的滞后有待于完善。我国《会计法》规定，单位负责人对本单位的会计工作和会计资料的真实性完整性负责。按照会计集中核算体制的现状在会计集中核算过程中被审计单位部门原来的会计责任在被审计单位、部门与核算中心之间发生一定转变。被审计单位部门原来承担的全部会计责任有部分转变到了核算中心。会计核算中心主要是对会计核算工作的真实性，完整性负责，同时对会计资料的安全性，完整性负责，但会计责任主体还是被审计单位领导人。因此，在会计责任发生变化后，开展内部审计工作需要对这些问题作进一步 研究 探索，更需要有关部门及时出台这方面的准则进行规范。
3、新出现的违规违纪现象增添一些审计难度。成立中心后，一些单位部门为逃避核算中心会计监督，采取更加隐蔽的违纪方式，将资金转变到与之相联系的二、三级单位或者其它相关单位及协会、学会等社团组织，因此给内部审计检查难度加大。
4、由于中心单位开支标准不统一，对违规违纪开支不好认定，由于各单位，部门收支状况原本不同，没有统一开支标准，会计集中核算后各单位的财务收支集中在一个桌面上，因此标准问题凸现出来，以大宗材料，设备采购等大额费用支出，到差旅、电话费等小额费用支出，从招待、会议费的公务费用支出，到补贴、奖金等福利费用支出，因没有统一标准，不好确认其违规违纪问题。
5、会计核算中心对各单位、部门的经济事项缺乏有效的监督手段，增加审计难度。实行会计集中核算，撤销单位会计岗位，把单位经济、会计工作的直接执行者和知情者——单位会计人员撇到一边，而会计核算中心人员不参与各单位财务收支活动，对各单位具体工作和开支项目不十分清楚，在会计核算上往往只是注重审核其票据要素是否齐全，报销手续是否完整，不能对其反映的经济事项的真实性以及相关的合法性进行有效的监督，因此增加具体审计的难度。
二、实施会计集中核算制后内部审计工作应采取的应对措施
面对会计集中核算后给内部审计工作带来的影响，内部审计部门应当针对实际情况及时采取有效措施应对。同时还要充分认识到成立会计核算中心只不过是多了一道会计监督环节，但其代替不了内部审计，不能理解为因为加强了会计监督，而要削弱或取消内部审计监督，相反由于资金载体的变化以及其带来的影响，而要强化内部审计监督。因此，实行会计集中核算后，所属基层单位的内部审计任务不会从数量上发生变化，但在内部审计的客体、内容、重点、方式方法上面，要依据实际情况予以调整，从 目前 现状看，要从以下几方面采取措施。
（一）分清责任主体，规范操作程序。 会计 集中核算后，审计客体和对象出现了两个层面，一是被审计基层单位、部门，二是会计核算中心，根据客观实际，各基层单位部门的会计 法律 地位不变，其负责人仍是会计责任主体。应对本单位的财务收支和会计资料的真实性，完整性负责。因此，被审计基层单位部门和负责人仍是审计通知的主送单位，负责提供资料、承诺和签证，核算中心承担着各单位的会计核算职责，要对代管资金、会计核算、会计资料的安全性和完整性负责，即要承担一部分责任同时又因其各基层单位，部门会计资料、会计档案的集中地，还必须积极配合内审部门对各单位部门的审计，审计通知书同时抄送核算中心。
（二）适时调整审计目标，及时把握审计重点。在会计集中核算制下，财务管理与会计核算、会计监督职能分开，分别由被审计单位、部门和核算中心承担相关责任，根据体制变化产生的 影响 ，要适时调整方向，把握审计重点。
1、对被审计单位、部门要加强对核算中心在日常会计监督中涉及不到的和没有监督到位的会计事项进行审计监督，主要应从以下几个方面入手，一是内控制度的建立和执行，是否由于会计核算工作的转移，而丧失各项内控制度。二是收入（包括预算外收入和其他收入）的真实和完整。重点检查收入来源是否合规，是否全部入账，有无逃避会计核算中心将收入不及时报账，漏报、少报或不报账，转移下级单位，形成单位的“小金库”，搞账外账，三是支出的合规效益性。审核支出的结构和效益情况如何， 分析 行政事业成本的合理性，是否体现公共财政的要求，是否体现 社会 效益最大的原则，另外还要注意其发票，假项目等虚列支出套取资金的情况，尤其要对金额大，报销 内容 明显不合理的项目予以重视，四是实物资产的管理，要突出实物清查工作，就是要针对被审计单位部门实物资产管理薄弱的会计集中核算制各单位、部门与所属下一级单位以及社团、工会等组织的财务联系更加紧密，出现一些深层次的 问题 。因此在审计对象上要改变只审计一级财务单位的局限。鉴于以上几个方面，内部审计工作要及时改进审计的方式 方法 ，适应形势 发展 的需要，确保审计成效。具体要采取如下措施：
一是要做到两个现场审计的结合。首先要将会计核算中心作为实施内部审计的主要现场，并要求被审单位、部门的报账员到现场，对单位部门有关 经济 事项进行解答，同时根据情况还要将被审单位作为现场，进行相关事项的检查和审核。
二是要注重外围调查和实物清查。对于核算中心提供的会计资料是否全面、真实的反映了被审单位部门的财务状况，要注重外围调查工作，来全面掌握被审单位、部门收支项目和财务事项的变化和真实情况。由于会计核算职能的移出，被审单位会出现财务管理弱化的现象，尤其是在固定资产的管理上是较为薄弱的环节，因此要加大对实物资产的现场清查。
三是要强化延伸审计。要对被审单位、部门尚未纳入中心的资金、账户以及所属二、三级单位财务状况纳入审计。
四是要注重跟踪审计。对于在审计中发现的一些异常开支和往来款项要进行跟踪，查明是否存在与有关单位串通，采取虚列支出，转移收入等手段在外单位套现，违规列支等问题。会计集中核算制下各单位、部门与所属下一级单位，以及社团、工会等组织的财务联系更加紧密，出现一些深层次的问题。因此在审计对象上要改变只审计一级财务单位的局限。
