1、行政单位实施内部控制的必要性
(1)保证行政单位运行管理合法合规最基本的要求就是遵循法律法规。通过建立和完善内部控制可以确保行政单位行政行为依据的合法性，可以通过设置控制措施提高行政运行效率并及时发现和纠正存在的违法违纪现象。
(2)保证行政单位资源分配公平公正，行政单位在拥有众多行政权力的前提下，处于社会资源再分配的领域，应该平等地对待各相关利益团体，有效的内部控制可以确保将社会资源公平合理地分配给各利益主体，促进社会和经济更快更好地发展。
(3)保证行政单位对外公开的财务报表及数据真实可靠，公众可以根据行政单位对外公开的财务报表及数据信息了解行政单位的预算执行情况以及管理运行情况，同时管理层可以根据报表信息为其决策提供依据。另外，和企业所不同的是行政单位的预算报告是具有法定效力的，因此建立有效的内部控制是保证会计信息真实可靠，报表信息完整有效的重要手段。
(4)提高资金的使用效率和效果，预算管理可以反映行政单位在实现战略目标过程中资金的分配使用情况，同时也反映了其履行社会责任的情况，建立有效的内部控制制度，可以加强资金使用的管控力度，减少预算的随意性，完善预算执行标准，使实际支出和预算可以匹配，提高资金的使用效率和效果。
2、行政单位内部控制的问题
(1)控制环境的弱化当前我国在对行政单位的内部控制这方面还存在自区，缺失强制执行力，因此造成了部分单位负责人对内部控制不重视，抱着可有可无的态度，即使建立了内部控制规范，实际的操作性也不强。同时，部分单位普遍不重视财务工作人员的工作，并没有让财务人员参与到单位的一些重大经济决策事项，造成财务人员只是履行了付钱的作用。
(2)会计基础工作不规范，人为舞弊现象普遍存在大部分行政单位都存在原始凭证管理不规范、会计核算处理随意、会计数据信息失真、资产账与会计账不符等问题，政府采购、资产管理和账务处理等不规范问题频频出现，各级地方政府和行政单位的会计核算问题更为严重。
(3)控制活动缺失或流于形式，未能发挥作用。缺少文件化的内部控制制度。部分单位负责人认为一般的财务管理等同于内部控制，因此在管理方面缺少文件型的制度，造成了部分单位在预算管理、资金使用、资产保护等方面没有一个明确的标准。未能落实授权审批和定期核查。大多数行政单位长期都执行着领导签字就算数的审批形式，因此授权审批金额权限及领导联签等财务控制形式形同虚设。许多单位没有建立资产和资金的定期盘点制度，对财产定期核查得不到保证。未有效执行不相容岗位分离和实物控制。由于行政单位在实际工作过程中存在人员兼岗现象，存在一个财务人员同时保管单位财务章、法人印鉴以及支票等问题。收支两条线执行不到位，非税收入管理不规范。目前部分行政单位为了自身或者部门的利益，并没有落实收支两条线的管理政策，仍然将行政性收费、房屋的租赁收入等政府非税收收入。
(4)国有资产流失严重，与企业的会计人员相比，行政单位的会计人员在资金的使用过程中作用很小，其职责往往相当于记账人员，资金的使用一般是由领导说了算，领导签了字，会计人员便不再审核，从而造成了无计划支出、浪费等现象。此外，行政单位的固定资产是由国家财政拨款通过政府采购购置或通过基建项目转入，因此部分单位认为财政的资金不用白不用，导致购置、使用、保管、处置等环节缺乏严格管理，造成重复购置、账物不符、公物私占、低价处置等现象，也造成了国有资产的流失。
3、优化行政单位内部控制的对策
(1)完善行政单位内部控制法律建设，为内控实施提供法律保障，相关部门应该在已出台的企业内部控制相关法律法规的基础之上，结合行政单位的实际情况，通过制定不同方面的行政单位内部控制制度配套文件，使之形成一个相对完善的内部控制体系，使行政单位在内部控制方法、程序、模式等方面都有章可循。通过内部控制的全面实施，保护财经纪律、规范行政单位的财务管理活动、保护国有资产、提高财政资金的使用效率。
(2)顺应政府职能转变，关注风险防范关键点，政府职能的转变，对行政单位的职权范围带来了一定的影响，行政单位应通过采取相应措施以降低风险，如开展风险教育，端正执法态度及理念;强调执法规范化采取阳光执法的形式使行政权力公开透明化;建立健全执法考评制度等。加大对单位领导及财务人员的财务风险及相关制度的教育，通过信息网络技术建立财务风险预警系统进行财务风险动态监控，制定预算执行计划并按照计划合理开支，减少公务接待、会议开支等方式控制该风险点。
(3)深化财政体制改革，提高资金运行质量，实行全面预算管理，强化预算控制在行政单位内部控制中的功能作用，大力推行零基预算、综合预算，既要参考上年度预算的执行情况，又要采用科学的方法计划年度内各项工作开展可能需要的支出，制定严格的预算控制程序，做到预算执行科学性和合理性，并加强对预算、财政拨款收入实施有效监控，杜绝无计划申请拨款、浪费的现象，积极调动社会媒体、网络等公众舆论媒介从外界监管行政单位的非税收入活动，从而形成由内到外、多层次的有效监管。
(4)加快信息化建设，提升行政单位全面管控的信息化水平，提高行政单位办公效率，应实施办公自动化，逐步实现单位内部文件电子化的网络传播，减少纸质办公。同时，应开发和完善政府职能部门内部的局域网，将政府部门内部数据的录入、整理进行更新，以促进政府部门内部的资源共享。在内网成熟的基础之上，应逐步通过公众信息网络进行单位内网的信息沟通和资源共享，实现行政单位和社会公众之问的互通互联，充分发挥信息技术在信息沟通中的作用，提升单位全面风险管控能力。
(5)建立内部审计和外部监督机制，严肃责任追究制度，完善内部监督制度，设立专职稽核人员，对单位会计、财务及其他业务工作开展经常性稽核，对单位内部控制制度实行过程中的效率进行监控，及时发现存在的疏忽和不足之处，向领导进行报告并提出整改建议。开展外部监督，建立以政府监督为主、社会监督为辅的外部监督机制。协调与相关的监督机构和部门的监督关系，权衡好监管权，避免行政权力在监督过程中对财务活动过度干预，保证有关部门能够有效开展监督工作。
