医院是个高风险、高技术含量的行业，运用现代管理手段来管理医院十分必要。内部控制是医院管理的核心，是医院实现标准化、规范化动作的基础前提，加强内部控制建设不仅可以维护病患的合法权益，还可有效遏制医院内各种不正之风。目前，公立医院约占医院的96％，处于政府垄断经营状态，这就造成它们的竞争意识和经济效益观念不强，整体管理水平低，资源浪费问题严重。随着国家医疗体制改革的不断深入，社会力量办医和多形式的医疗服务机构如雨后春笋般出现，使公立医院产生了极强的危机感，如不尽快转变观念，运用现代管理手段搞活经营，势必面临入不敷出的经营危机。为此，首先从医院内部环境着手，采取合理的内部会计控制方法，切实解决医院资金管理存在的问题意义重大。
一、院内部会计控制存在的问题
1.内部会计控制环境薄弱。首先，医院在机构设置上过于求方便，对其合理性认识不足，岗位之间责任混淆，内部矛盾严重，管理效率低下。另外，各部门之间欠沟通，内部信息流通不畅，影响了内部会计控制的成效。其次，医院表面上遵守“公开、公正、公平”的招聘原则，但实际则过于重视自身利益，人员招聘暗中操作多，人员素质较低根本不能正确的对医院经济活动进行反映，并且在一定程度上助长了不法行为的气焰。第三，医院的管理层多数来自于医疗领域，他们在管理的执行上更重视医疗技术建设而对职内的法律和财务方面认识不足。
2.内部会计控制体系不完善。首先，没有健全的信息系统。信息技术给企业内部会计管理带来极大的方便，不仅降低了工作人员的劳动强度还使会计信息的准确性、及时性得到有效提高。但公立医院在政府的庇护下会计控制信息化程度不高，许多医院仍留在传统记账、算账阶段。另外，医院所用信息管理系统是由软件公司编制，出现问题后只能通过软件公司来解决，可能给医院的财务管理带来隐患。其次，缺乏有效的风险管理机制。市场环境瞬息万变，任何单位都存在经营风险，公立医院同样如此。目前，我国医院在医疗风险、经营风险和投资风险等方面都处于一个启蒙阶段，在认识和制度上都有很多不足。
3.内部审计监督力度不足。内部审计是一项独立的评价活动，主要检验医院会计活动的合法性和有效性。但实际当中，审计部门往往置于财务部门之下，基本没有独立性可言，致使审计监督力度不够；审计人员素质不高，审计工作大多集中在事后审计上而对事前和事中审计不够重视，大大降低了内部审计的质量。另外，领导对审计的重视不足，甚至将其看成应付上级检查的工具，根本不对本单位的财务会计活动进行监督检查。
二、医院内部会计控制的实施策略
1.构建良好的内部会计控制环境。医院组织结构的设立要符合医院的实际情况，务必保证各机构之间关系协调，权利义务相互衔接。目前，我国医院逐渐向集团化方向发展，这就要求医院尽快建立起有利于组织管理和控制的组织结构。但无论何种形式，权利与义务的制衡关系是根本，有效的会计监督是保证。在人员考察方面，要明确领导层的职能，机构负责人的权限以及完善各部门会计人员职业道德和职业水平的考察机制；在人员录用方面，医院应尽快摆正“不愁吃穿”的错误思想，尽快建立严格的人员聘用机制和激励机制，切实提高会计人员的整体质量。在管理认知方面，管理者不应局限于拥有丰富的医疗知识和执刀经验的人，医院应广纳良才，多引进和培养一些全能型的高素质人才成为管理者。
2.加强医院内部会计控制体系建设。医院信息系统建立应符合国家相关规范和标准，在国家监督下制定。信息系统是将许多不相干的工作统一执行，这就增加了内部控制的风险。因此，可将操作与监控分成两个岗位，一旦录入数据就会被监控人员同步备份，如果审计部门检查时对数据有怀疑的可从监控人员那里调取资料。同时医院还应设置专门的软、硬件管理员，严格限制无权限账号的进入。其次，建立完善的风险评估制度。在医疗方面，加大对临床的指导与牵引，制定临床风险控制点并加大监督力度，防止医疗风险的发生；在经营方面，根据医院各科室的特点建立相应的制约机制，避免一人或某一部门的单独决策，同时密切关注医院外部环境的变化，对新的竞争对手的实力进行综合评估；在投资方面，购置新设备或扩大经营规模之前必须考虑医院的实际需求以及市场行情，同时由财务部门出据可行性分析报告后方可执行。第三，建立有效的激励机制。医院应定期对内部会计控制制度的执行情况进行考评，并根据考评结果进行奖惩。工作人员过错无论大小都应一视同仁，避免有过错却不管不问或处罚流于形式的现象。
3.强化内外部监督力度。要提高我国医院内部审计部门的监督力度，一要合理的设置内审部门，将该部门置于其他职能部门之外，以便于内审部门能独立的开展工作；二是要恰当的配备内审人员，并且定期对其进行继续教育，提高他们的审计素质及职业道德水平，为内部审计工作的有效开展提供足够的资源；三是要加强管理层对内部审计的认识，了解内部审计的范围与作用，使他们意识到内部审计的重要性，并积极促成内部审计工作的开展，从而方便内部审计人员顺利的实施审计项目，充分发挥内部审计在内部会计控制体系中的作用。
